Javier Álvarez realizó estudios de composición musical con Mario Lavista y con John Downey, y continuó sus estudios superiores en el Royal College of Music, y de Doctorado en la City University en Londres (Reino Unido). Álvarez tiene en su haber una amplia trayectoria académica y docente en centros de reconocido prestigio, como el Royal College of Music y el Guildhall School of Music and Drama en Londres, y como Catedrático de composición en la Universidad de Hertfordshire. Fue nombrado en 2008 Rector del Conservatorio de las Rosas (México), cargo que desempeña en la actualidad. Ha recibido encargos de festivales como Otoño de Varsovia, Agora, Tanglewood, Hudders-field, Darmdstadt, Ojai, Présences-Radio France, Bergen, Música/Strasburg y Cervantino, y además es invitado habitual de importantes centros de investigación musical, como el Institut de Recherche et Coordination Acoustique/Musique (IRCAM) o el Groupe de Recherches Musicales (GRM) en Francia.